Kiểm toán chỉ ra còn tình trạng thu một số khoản chưa có trong quy định như Gia hạn thời gian học tập, bồi dưỡng kiến thức đầu vào, lệ phí bảng điểm, lệ phí làm thẻ sinh viên, khấu hao trang phục, bằng tốt nghiệp, lệ phí phúc khảo, lệ phí thư viện, xét miễn môn học, phí sinh hoạt công dân đầu khoá.