TCDN - KTNN chỉ ra Viện Hàn lâm Khoa học và Xã hội có một số đề tài khoa học không thực hiện theo ý kiến Hội đồng; một số đề tài được ấn định kinh phí trước khi trình ra tổ thẩm định kinh phí. Ngoài ra, Viện HLKHXH chưa ghi thu - ghi chi theo quy định với số tiền 3,498 tỷ đồng.

Theo kết quả kiểm toán năm 2021, KTNN chỉ ra rằng Viện Hàn lâm Khoa học và Xã hội (Viện HLKHXH) cơ sở lập chưa đảm bảo như: Lập dự toán kinh phí sửa chữa, bảo trì, cải tạo, nâng cấp, mở rộng cơ sở vật chất thiếu thuyết minh chi tiết về tên công trình; mục tiêu sửa chữa, bảo trì, cải tạo nâng cấp mở rộng; sự cần thiết, lý do thực hiện…

Việc phân bổ kinh phí sửa chữa tại Bảo tàng dân tộc học Việt Nam 1,5 tỷ đồng khi chưa đủ cơ sở dẫn đến Bộ Tài chính phải yêu cầu phân bổ lại; phân bổ kinh phí hoạt động không thường xuyên chi mua sắm tài sản nhỏ (máy tính, máy in...) thuộc định mức chi thường xuyên theo Quyết định số 46/2016/QĐ-TTg ngày 19/10/2016 của Chính phủ 0,795 tỷ đồng. 

Ngoài ra, Viện HLKHXH còn hạn chế trong việc xây dựng, phê duyệt đề án vị trí việc làm Viện và triển khai thực hiện theo Nghị quyết số 39-NQ/TW ngày 17/4/2015 của Ban Chấp hành Trung ương và các văn bản liên quan của Chính phủ, Thủ tướng Chính phủ. Viện HLKHXH đã xây dựng đề án xác định vị trí việc làm trình Bộ Nội vụ nhưng chưa được phê duyệt.

KTNN chỉ ra, Chủ tịch Viện HLKHXH chưa thực hiện giao số người làm việc và hợp đồng lao động đối với từng đơn vị sự nghiệp theo đề nghị của Bộ Nội vụ làm cơ sở lập và phân bổ dự toán hàng năm.

Việc quản lý nhiệm vụ, dự án KH&CN: Công tác đề xuất, tuyển chọn, xét chọn nhiệm vụ, dự án KH&CN còn thiếu sót tại Viện HLKHXH không thực hiện xét tuyển chọn đề tài thông qua Hội đồng tư vấn xác định nhiệm vụ KHCN; một số đề tài, giữa danh mục đề xuất, ý kiến của Phó Chủ tịch duyệt và thực tế thực hiện không trùng khớp nhau; Học viện Khoa học xã hội chưa tổ chức họp Hội đồng khoa học xét duyệt đề xuất đề tài cấp Bộ theo quy định.

Việc thực hiện đề tài khoa học còn hạn chế tại Viện HLKHXH một số đề tài không thực hiện theo ý kiến Hội đồng; một số đề tài được ấn định kinh phí trước khi trình ra tổ thẩm định kinh phí.

Ngoài ra, thời gian thực hiện chưa đảm bảo quy định tại Viện HLKHXH: Có 17 đề tài, nhiệm vụ phải xin gia hạn, đặc biệt chương trình cấp quốc gia "Nghiên cứu khu di tích khảo cổ học Óc Eo-Ba Thê-Nền chùa" phải gia hạn 03 lần (thời gian gia hạn 03 năm); ngoài ra còn một số đề tài, một số nhiệm vụ bị chậm so với kế hoạch đề ra (tổ chức toạ đàm, hội thảo, khảo sát).

Viện HLKHXH chưa thực hiện xử lý đối với trường hợp nhiệm vụ KHCN không hoàn thành theo quy định. Năm 2021, có 01 chương trình trọng điểm cấp Bộ và 01 đề tài cấp Bộ dừng thực hiện, tuy nhiên đến thời điểm kiểm toán, đơn vị chưa cung cấp được hồ sơ liên quan đến việc dừng thực hiện.

Hồ sơ quyết toán chưa đầy đủ, chưa đúng quy định tại Viện HLKHXH chi trả tiền công lao động trực tiếp cho các cá nhân thực hiện nhiệm vụ không chuyển vào quỹ tiền lương, tiền công theo quy định; chi phí quản lý chung (5% kinh phí đề tài) chi cho một số cá nhân thực hiện quản lý đề tài, chưa sử dụng kinh phí quản lý chung chi cho điện, nước, các khoản chi hành chính phát sinh theo quy định.

Một số đơn vị sự nghiệp công lập chưa trích lập nguồn CCTL, không lập dự toán chi thực hiện CCTL theo quy định, Viện HLKHXH: Bảo tàng dân tộc học Việt Nam chưa trích lập tạo nguồn CCTL 0,275 tỷ đồng.

Viện HLKHXH chưa ghi thu - ghi chi theo quy định Viện HLKHXH: 3,498 tỷ đồng.

Viện HLKHXH việc thực hiện tự chủ còn hạn chế, hầu hết các đơn vị trực thuộc vẫn chủ yếu từ nguồn NSNN hỗ trợ, nguồn thu khai thác bên ngoài thấp và không ổn định đặc biệt trong năm 2021 do ảnh hưởng của dịch bệnh Covid-19 đã ảnh hưởng rất lớn đến nguồn thu dịch vụ của các đơn vị (Bảo tàng dân tộc học, Học viện KHXHVN...) vì vậy đã ảnh hưởng rất lớn đến mức độ tự chủ của các đơn vị.

Việc thu, chi học phí chưa phù hợp việc Học viện KHXH còn thu vượt học phí đào tạo tiến sĩ, chưa thực hiện miễn giảm học phí đầy đủ theo quy định.

Quản lý, sử dụng xe ô tô của một số đơn vị (Bảo tàng Dân tộc học, Viện Nghiên cứu Trung Quốc, Viện Xã hội học) chưa đủ điều kiện tiêu chuẩn sử dụng xe ô tô dùng chung theo theo quy định nhưng vẫn được trang bị.

Quản lý, sử dụng tài sản là nhà, đất chưa thực hiện sắp xếp lại, xử lý nhà đất theo quy định tại Viện HLKHXH chưa thực hiện rà soát, sắp xếp lại tài sản theo quy định tại Nghị định số 167/2017/NĐ-CP.

Viện HLKHXH: 01 điểm thuê chưa thực hiện lập đề án cho thuê tài sản theo quy định của Luật Quản lý tài sản công (Đơn vị còn cho Công ty TNHH MTV Thủ công Trúc Lâm thuê quầy bán đồ thủ công mỹ nghệ có diện tích 45,5m2). 

Chưa xây dựng quy chế quản lý, sử dụng tài sản công tại một số đơn vị chưa xây dựng, ban hành Quy chế quản lý, sử dụng tài sản công theo quy định. 

Viện HLKHXH chưa gửi BCQT ngân sách năm 2021 về KTNN trước ngày 01/10/2022 theo quy định.